蛋白质在体内的多种生理功能作用可归纳为三方面。

蛋白质的作用一：构成和修补人体组织：蛋白质是构成细胞、组织和器官的主要材料。婴幼儿、儿童和青少年的生长发育都离不开蛋白质。成年人身体组织的更新也需要蛋白质，例如，小肠黏膜细胞每1-2天即更新一次，血液红细胞每120天更新一次，头发和指甲也在不断地新陈代谢，这些生理过程均需要一定量的蛋白质。身体受伤后的修复也需要依靠蛋白质来补充。

蛋白质的作用二：调节身体功能：在体内新陈代谢过程中起催化作用的酶，调节生长、代谢的各种激素以及有免疫功能的抗体都是由蛋白质构成的。此外，蛋白质对维持体内酸碱平衡和水分的正常分布也有着重要作用。

蛋白质的作用三：供给能量：虽然蛋白质的主要功能不是供给能量，但当食物中蛋白质的氨基酸组成和比例不符合人体的需要，或摄人蛋白质过多，超过身体的需要时，多余的食物蛋白质就会氧化分解放出热能。此外，在正常代谢过程中，陈旧破损的组织和细胞中的蛋白质也会分解释放出能量。每克蛋白质可产生16．7千焦耳(4千卡)热能。